| 模块 | 功能项 | 子功能点 | 具体功能项说明 |
|---|---|---|---|
开发者模式 | 开发者模式IDE | 开发者模式IDE | 【新增】支持开发者模式IDE中执行python或者R代码运行 |
| 【新增】支持python和R代码语法检查及高亮 | |||
| 开发者模式设置 | 【新增】支持设置开发者模式启动规格，包括计算规格，存储规格及启动时间 | ||
| BioAI助手（Beta） | BioAI助手（Beta) | BioAI助手 | 【新增】在AI助手中新增产品问答，文献引证，代码生成助手 |
| 【新增】支持查看对话历史，修改对话名称，清楚上下文 | |||
| BioAI助手设置 | 【新增】支持设置自定义系统提示词 | ||
Workspace | Notebook | Notebook API | 【新增】提供CreateNotebookRun/GetNotebookRunStatus接口支持通过API执行Notebook运行以及状态查询 |
| 工作流 | 工作流导入 | 【新增】工作流导入时如果导入失败，将失败信息展示在工作流卡片 |
| 模块 | 功能项 | 子功能点 | 具体功能项说明 |
|---|---|---|---|
| 开发者模式 | 开发者模式IDE | 开发者模式IDE | 【新增】新增开发者模式，支持在线IDE能力，支持IDE开发写作，支持用户在开发者模式中开发生信脚本或流程 |
| 【新增】在开发者模式IDE中支持WDL高亮 | |||
| 【新增】开发者模式IDE中支持挂载对象存储，可直接读写tos对象 | |||
开发者模式插件 | 开发者模式支持插件使用 | 【新增】在开发者模式中新增工作流插件，支持同步更新生产模式中工作流 | |
| 【新增】在开发者模式中新增shell插件，在开发者模式中执行shell命令 | |||
| 【新增】在开发者模式中新增Desktop插件，支持在开发者模式中启动云桌面 | |||
| 【新增】在开发者模式Desktop插件中可支持启动relion工具 | |||
| Workspace | 工作流 | 支持复制工作流 | 【新增】支持工作流在workspace之间进行复制 |
| 支持从公共workspace中复制工作流 | 【新增】支持可以从公共workspace中复制工作流到个人workspace | ||
| 支持工作流下载 | 【新增】支持下载工作流中的WDL | ||
| 新增运行选项 | 【新增】在工作流运行选项中增加tos挂载选项，可选择运行时是否挂载tos对象存储桶 | ||
| 分析历史 | 分析历史 | 【优化】在分析历史执行目录跳转可直接跳转到工作流对应目录 |
| 模块 | 功能项 | 子功能点 | 具体功能项说明 |
|---|---|---|---|
Workspace | 工作流 | 工作流配置 | 【优化】工作流配置输入参数为文件类型时可多选并多行展示 |
| 【新增】输入参数支持复合函数（Array类型嵌套、Object\Map、Pair等） | |||
| 工作流导入 | 【优化】工作流导入优化，Graph解析失败不影响流程导入 | ||
| 数据 | 文件列表 | 【优化】当前文件列表匹配用户对象存储权限，仅当有对象存储访问权限时可访问文件列表 | |
| Notebook | 保存镜像 | 【新增】支持保存镜像错误时查看日志 | |
| 运行配置 | 【新增】增加Notebook访问对象存储说明 | ||
| 公共模块 | 配额管理 | 配额管理 | 【新增】支持用户在火山配额中心中申请配额 |
| 云产品依赖 | 新增云产品依赖页面 | 【新增】新增Bio-OS依赖产品展示并支持开通镜像仓库内网访问 |
| 模块 | 功能项 | 子功能点 | 具体功能项说明 |
|---|---|---|---|
Workspace | 工作流 | 工作流运行支持挂载tos | 【新增】支持工作流运行过程中无需从tos复制而是直接挂载tos桶，提升效率 |
| 工作流参数支持配置密钥 | 【新增】支持在工作流参数中配置AKSK密钥，以支持tos挂载 | ||
| Notebook | Notebook运行配置 | 【优化】选择镜像存档后展示镜像详情 | |
| Notebook运行 | 【优化】独立Notebook启动kernel参数，减少启动时包冲突问题 | ||
CLI | Bioctl命令行工具 | 支持Bioctl进行Workspace相关命令 | 【新增】通过Bioctl Workspace相关command可以进行Workspace的创建、导入、导出、删除等 |
| 支持Bioctl进行Workflow相关命令 | 【新增】通过Bioctl Workflow命令进行工作流导入，删除，罗列工作流投递历史 | ||
| 支持Bioctl进行投递相关命令 | 【新增】通过Bioctl submission命令进行投递、终止投递、查询投递状态、查询运行输出 | ||
| 支持Bioctl进行Datamodel相关命令 | 【新增】通过Bioctl datamodel命令进行数据模型导入，删除、罗列 |
| 模块 | 功能项 | 子功能点 | 具体功能项说明 |
|---|---|---|---|
Workspace | 工作流 | 工作流输入参数类型扩展 | 【新增】工作流输入参数支持array int/float/boolean类型 |
| Notebook | 支持Notebook保存镜像 | 【新增】支持用户在Notebook运行中将当前环境保存为镜像 | |
| Notebook | 支持新的Notebook启动方式 | 【新增】支Notebook选择镜像存档启动 | |
| 数据 | 文件上传下载优化 | 【优化】支持文件批量下载和删除 |
| 模块 | 功能项 | 子功能点 | 具体功能项说明 |
|---|---|---|---|
| 公共 | 公共 | 新增个人+企业认证 | 【新增】开通Bio-OS产品时需进行个人或企业认证 |
Workspace | workspace列表 | workspace卡片 | 【优化】workspace卡片优化，更完整的标题和描述展示 |
workspace列表 | workspace标签 | 【新增】支持为Workspace设置标签，可根据标签进行分类和筛选 | |
| workspace | 创建workspace默认关联共享集群 | 【新增】创建workspace时默认关联共享集群，无需再手动关联集群 | |
工作流 | 工作流导入 | 【新增】支持通过本地上传导入工作流 | |
| 工作流导入 | 【新增】支持通过TRS ID导入工作流 | ||
| 工作流投递 | 【优化】支持重新投递时设置投递参数 | ||
| Notebook | 运行设置 | 【新增】支持Notebook挂载EBS存储盘进行扩容（超过20G存储后会额外收费） | |
| 数据集 | 数据集列表 | 数据集卡片 | 【优化】数据集展示优化，增加列模式 |
| 数据集元数据 | 数据集元数据规则 | 【优化】优化数据集/文件相关的元数据规则 |
| 模块 | 功能项 | 子功能点 | 具体功能项说明 |
|---|---|---|---|
| 公共Workspace | 公共Workspace克隆 | 克隆公共Workspace | 【优化】优化公共Workspace发布和克隆效率 |
| 概览 | 概览页 | 概览 | 【优化】全面优化概览页，新增最近访问Workspace、资源中心、Bio-OS最佳实践、使用指南和常见问题，同时支持主账号查看当前所有工作流和Notebook总数以及所有Notebook实例并支持删除关联云盘 |
| Workspace | Workspace | Workspace | 【新增】创建Workspace时支持从公共Workspace克隆 |
| Notebook | Notebook运行 | 【优化】Notebook以pip或者conda安装时默认使用国内源 | |
| Notebook | Notebook运行配置 | 【新增】Notebook运行配置新增计算规格和磁盘费用预估 | |
| Notebook | Notebook运行配置 | 【新增】Notebook提供免费20G磁盘用量 | |
| Notebook | Notebook运行配置 | 【新增】支持删除Notebook环境（配置及存储盘） | |
| Notebook | Notebook运行配置 | 【新增】Notebook新增两个预设镜像Bioconductor和GATK |
| 模块 | 功能项 | 子功能点 | 具体功能项说明 |
|---|---|---|---|
| 应用仓库 | 数据集 | 数据集展示 | 【新增】新增数据集模块，展示公共数据集 |
| 数据集文件计算 | 【新增】支持工作流输入参数关联数据集中的文件作为参考文件 | ||
| Workspace | Workspace列表页 | Workspace排序 | 【新增】默认按访问时间排序，支持按访问时间升降序排序 |
| Notebook | Notebook | 【新增】Notebook内使用pip安装默认使用国内源 | |
| SDK | SDK | SDK版本更新 | 【新增】更新SDK，加入Notebook相关接口 |
| 模块 | 功能项 | 子功能点 | 具体功能项说明 |
|---|---|---|---|
| 应用仓库 | 公共Workspace | 公共Workspace | 【新增】Bio-OS将提供公共Workspace，并支持从公共Workspace克隆到自己的Workspace中 |
Workspace | IAM | 自定义策略 | 【新增】支持主账号为用户设定自定义策略分配权限 |
工作流 | 工作流运行 | 【优化】优化工作流运行过程中已完成的pod占用pod quota | |
| 工作流运行 | 【优化】优化节点池扩容失败后的重试 | ||
| 工作流运行 | 【优化】优化tos限流导致的下载速度为0且无法恢复 |
| 模块 | 功能项 | 子功能点 | 具体功能项说明 |
|---|---|---|---|
Workspace | 工作流 | 工作流投递 | 【新增】任务运行新增GPU型号A10支持 |
| 任务资源监控 | 【优化】Task运行完成后保留ResourceClamed | ||
| 任务调度 | 【优化】Pioneer调度套件优化 | ||
| 分析历史 | 分析状态 | 【优化】投递状态由“分析成功”和“分析失败”转为“分析完成” | |
Notebook | 自定义镜像 | 【优化】报错提示信息优化 | |
| 运行资源配置 | 【优化】修改Notebook运行资源配置后，提示信息优化 | ||
| 存储挂载 | 【新增】共享集群支持Notebook挂载tos | ||
| 数据管理 | Workspace级别数据模型 | 【优化】Workspace Data数据模型增加校验规则 | |
| SDK | 数据管理 | 使用SDK上传数据模型 | 【优化】CreateDataModel兼容List |
| 模块 | 功能项 | 子功能点 | 具体功能项说明 |
|---|---|---|---|
Workspace | Workspace列表 | Workspace支持离线分享 | 通过Workspace Schema实现Workspace的导入和导出功能，实现跨主账号的离线分享 |
工作流 | 查看资源监控 | 支持查看工作流运行中资源监控（共享集群） | |
| 实时日志 | 支持查看运行中实时日志（共享集群） | ||
| 分析历史新增停止操作 | 支持终止投递或者工作流运行 | ||
| 分析历史投递新增重新投递 | 支持对分析历史中的记录重新投递 | ||
分析历史新增总耗时 | 原有task列表中分析耗时修改为总耗时，新增分析耗时仅统计task具体执行时长 | ||
投递运行状态细化 | 投递状态新增"已终止"及“终止中”状态 | ||
| WDL的图形化展示 | 支持导入的WDL解析为DAG图 | ||
| Notebook | 支持Notebook以自定义镜像启动 | 支持选择自定义镜像启动Notebook实例 | |
| Notebook单元格支持插入复制图片 | 通过复制粘贴一键在notebook中插入外部图片 |
| 模块 | 功能项 | 子功能点 | 具体功能项说明 |
|---|---|---|---|
Workspace | 工作流 | 共享集群支持GPU运行 | 当工作流关联共享集群后，支持工作流调度到A30、T4两种GPU规格上 |
| 模块 | 功能项 | 子功能点 | 具体功能项说明 |
|---|---|---|---|
| Workspace | 工作流 | 工作流输入参数支持文件选择 | 【新增】工作流输入参数支持文件选择 |
| 支持WDL中GPU参数 | 【新增】支持WDL中GPU参数并调度到专属集群的VKE集群 | ||
| Notebooks | Notebook支持挂载对象存储 | 【新增】Notebook关联专属集群为VKE集群时可挂载对象存储 | |
| Notebook支持文件列表展示 | 【新增】支持Notebook直接读取文件列表数据 | ||
| Notebook支持性能监控 | 【新增】Notebook实例支持查看CPU和内存使用 | ||
| 集群管理 | 共享集群 | 创建共享集群 | 【新增】支持创建共享集群 |
| 专属集群 | 创建专属集群 | 【新增】支持创建共享集群，移除原有纳管集群 | |
| 专属集群密钥配置 | 【新增】专属集群可配置密钥，用于获取用户的TOS对象存储桶 |
| 模块 | 功能项 | 子功能点 | 具体功能项说明 |
|---|---|---|---|
| 集群管理 | 集群列表 | 删除纳管集群 | 【BUG修复】修复在解除纳管时，如当前集群不存在，无法解除纳管的问题 |
Workspace | 工作流 | 导入工作流 | 【优化】导入工作流时支持从github导入 |
工作流运行 | 【优化】支持工作流私有镜像时call cache | ||
| 【优化】支持以非数据模型开启工作流运行 | |||
| 【BUG修复】修复部分情况下无法拉取镜像的问题 | |||
| 分析历史 | 分析历史详情查看 | 【BUG修复】修复分析历史点击查看输入/输出参数页面空白 | |
环境管理 | 关联集群 | 【BUG修复】修复未纳管集群时，关联集群页面空白的问题 |
| 模块 | 功能项 | 子功能点 | 具体功能项说明 |
|---|---|---|---|
| 集群管理 | 纳管新集群 | 纳管VKE集群 | 选择当前账号下的VKE集群并进行纳管，纳管后可在Workspace中关联 |
| 集群列表 | 删除纳管集群 | 点击删除可将已纳管集群删除 | |
| 刷新集群列表 | 点击刷新按钮获取集群列表中集群状态 | ||
| 概览 | 帮助文档 | 点击跳转用户帮助文档 | |
| Workspace | workspace列表 | 列表操作 | 新建、编辑、删除Workspace |
| Dashboard | 编辑Dashboard | 点击进入Notebook编辑页面 | |
| 显示Workspace详情 | 显示Workspace名称、描述、关联集群、集群类型、存储桶、Owner以及创建时间 | ||
| 数据 | 文件列表 | 页面上传文件、上传文件夹、创建文件夹、删除文件/文件夹 | |
| 显示文件详情 | |||
| 复制文件http以及S3链接地址 | |||
| 实体数据模型 | 下载CSV模版并导入CSV | ||
| 下载、删除表格数据 | |||
| 支持生成数据集合 | |||
| Workspace数据模型 | 下载CSV模版并导入CSV | ||
| 下载、删除表格数据 | |||
| Notebooks | 新建Notebook | 新建、编辑、删除Notebook | |
| 复制Notebook | 复制notebook到任意Workspace | ||
| 运行资源配置 | 应用配置：选择启动镜像（三个预设镜像） | ||
| 资源配置：选择Notebook启动资源（CPU、内存） | |||
| 工作流 | 导入工作流 | 从git仓库中导入工作流 | |
| 工作流列表 | 更新、删除工作流，搜索、刷新工作流、按名称排序、按创建时间排序 | ||
| 详情工作流 | 工作流描述文件、输入/输出参数展示 | ||
| 运行配置：输入样本数据选择、输入参数、输出参数 | |||
| 工作流支持按规则下拉列表进行配置 | |||
| 支持输入输出参数下载、上传json文件 | |||
| 运行分析工作流 | |||
| 分析历史 | 分析历史列表 | 查看分析历史详情、删除分析历史 | |
| 分析历史详情查看 | 查看数据实体对应的工作流运行状态 | ||
| 查看此次分析概览信息 | |||
| 查看每个工作流中task级别的运行状态 | |||
| workflow configration支持工作流输入样本+配置复现 | |||
| 环境管理 | 工作流关联集群 | 关联工作流的运行集群 | |
| Notebook关联集群 | 关联Notebook启动集群 |