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Workspace理念
最近更新时间:2023.08.15 09:48:31首次发布时间:2022.10.30 09:50:22

在Bio-OS生信操作系统中,workspace是对一次生信研究过程的完整封装,包括数据,环境,代码,操作计算过程和结果以及作为整体介绍的dashboard,是实现科学研究和临床应用可执行,可移植,可复现,可分享,可发表的基本单位。
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  • 生信数据集管理:Bio-OS中的数据存储在云端,用户能够通过链接的形式进行直接使用,而不用下载到本地存储,从而节省传输时间成本和存储成本

  • 生信数据模型:存储在云中不同位置的数据能够通过数据表格的形式有效的组织和展示,能够作为向量化计算的基础,同时也可将计算结果写回至数据表格

  • 工作流:能够灵活、便捷的通过工作流开展基任意规模的基因分析任务

  • 实时交互分析环境:通过提供符合生信从业人员使用习惯的实时交互分析环境,能够帮助用户可视化和分析任何规模的数据

  • Dashboard:作为对在Workspace中所做的所有研究的整体介绍,能够记录研究过程中的数据资源、工作流资源以及操作步骤等信息,此外还能通过具备的交互分析环境能够复现Workspace中的研究

  • 云原生化调度:支持容器集群作为后端计算资源,保证资源利用率,同时能够保证环境统一,可复现

  • GA4GH开放标准支持:从数据、工具等层面全面支持GA4GH开放标准,融入社区生态