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Workspace介绍
最近更新时间:2024.01.24 11:57:21首次发布时间:2022.10.30 09:50:22

工作空间(Workspace)

工作空间是用户在Bio-OS上所创建的一个工作环境,其中包含基因数据,工作流,实时交互分析环境以及分析结果。通常会是一个完整的项目。工作空间可以被用作数据管理,资源配置,工作流配置以及论文投递的一个基本单位。

工作空间介绍

工作空间中包含Dashboard,数据,Notebooks,工作流,分析历史,环境管理六个部分。

  • Dashboard:作为对在Workspace中所做的所有研究的整体介绍,能够记录研究过程中的数据资源、工作流资源以及操作步骤等信息,此外还能通过具备的交互分析环境能够复现Workspace中的研究。

  • 数据:对生信数据以及数据模型进行管理

  • Notebooks:基于jupyter notebook,通过提供符合生信从业人员使用习惯的实时交互分析环境,能够帮助用户可视化和分析任何规模的数据

  • 工作流:能够灵活、便捷的通过工作流开展基任意规模的基因分析任务

  • 分析历史:记录投递分析、工作流运行、task运行多层级,细粒度的历史

  • 环境管理:关联当前Workspace中工作流及Notebook所运行的集群

创建工作空间

点击左侧边栏Workspace,选择新建workspace。新建工作空间有两个选项:

  • 新建空白Workspace:创建一个空白的工作空间,输入名称和简短描述

  • 从公共Workspace内复制:公共Workspace是一个公开,可分享的workspace仓库,可以将公共Workspace内的工作空间克隆并进行修改

  • 导入Workspace文件,可以将导出的Workspace压缩包文件导入

名称*:由中文、数字、字母、连接符(-、_)组成。不能由连接符(-、_)开头, 1 ~ 60 个字符之内。
简短描述*:简短描述不能为空,且不能超过1000个字符

Workspace导出

支持将Workspace导出成zip文件,文件中会包含元数据yaml文件,定义Workspace参数,以及对应的数据模型、工作流WDL以及Notebook文件等

#### Workspace编辑

可对Workspace进行名称、描述以及封面的编辑